在正常情况下，阴道细菌主要是乳酸杆菌，它可抑制厌氧菌生长，使阴道中的厌氧菌与需氧菌之比维持在正常的2：1—5：1之间，形成正常菌群生态平衡而不致病。当阴道内细菌生态失去平衡时，就会导致细菌性阴道疾病，常见的有嗜血杆菌性阴道病、非特异性阴道病、加特纳肝菌性阴道病、厌氧菌性阴道病等，统称为“细菌性阴道病”，多见于15-44岁的女性。不论何种类型的细菌性阴道病，其特征均是PH值大于4.5，阴道分泌物增多，有腐臭和鱼腥味，少数病人外阴瘙痒或烧灼感。但阴道壁无充血、红斑等炎症表现，也查不出大量白细胞聚集，只不过其他杂菌大大多于乳酸杆菌，使有益于阴道的乳酸杆菌失去作用。
这些杂菌在阴道中大量繁殖，可产生高浓度的亚硝氨，久之，可通过宫颈人乳头瘤病毒的作用而致癌；还可引发经期出血过多或妊娠性子宫内膜炎、输卵管炎、盆腔炎、异位妊娠或不孕症，乃至泌尿系统的反复感染；已孕妇女可引发胎膜早破、羊水污染、绒毛膜羊膜炎、早产及产褥期感染等；行子宫切除术者，术后阴道残端感染的机会大为增加。
临床上遇到的细菌性阴道病中，以加特纳杆菌感染为多。近来加特纳细菌性阴道病被认为是由加特纳杆菌和某些厌氧菌共同引起的。研究表明，当分泌物中加特纳杆菌占优势或与某些厌氧菌共存时，产生胺类，引起血管通透性增强、分泌物增多等临床表现。本病可通过性交传染，女病人配偶的尿道中90%可检查出加特纳杆菌，尿液培养阳性率达79.9%；如配偶不及时治疗，其妇女的重复感染率较高。在性关系混乱的人群中，本病有较高的发病率
